Protein–RNA interactions for Protein: Q1RME4

Gm1123, CAR-like soluble protein, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1123Q1RME4 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Gm1123Q1RME4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm1123Q1RME4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms