Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cpne9Q1RLL3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cpne9Q1RLL3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
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