Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Traf3ip1Q149C2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Traf3ip1Q149C2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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