Protein–RNA interactions for Protein: Q08024

Cbfb, Core-binding factor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CbfbQ08024 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CbfbQ08024 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CbfbQ08024 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms