Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Pou6f1Q07916 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms