Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Siah2Q06986 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Pid1-205ENSMUST00000176720 450 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm37720-201ENSMUST00000195497 1241 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Siah2Q06986 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms