Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Scg2Q03517 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Scg2Q03517 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms