Protein–RNA interactions for Protein: Q02496

Muc1, Mucin-1, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Muc1Q02496 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Muc1Q02496 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Muc1Q02496 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms