Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
H3f3aP84244 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H3f3aP84244 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms