Protein–RNA interactions for Protein: P82347

Sgcd, Delta-sarcoglycan, mousemouse

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Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcdP82347 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SgcdP82347 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SgcdP82347 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SgcdP82347 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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