Protein–RNA interactions for Protein: P62080

Tspan5, Tetraspanin-5, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan5P62080 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Tspan5P62080 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Tspan5P62080 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms