Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
NcstnP57716 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
NcstnP57716 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms