Protein–RNA interactions for Protein: P56564

Slc1a3, Excitatory amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a3P56564 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Slc1a3P56564 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Slc1a3P56564 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms