Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Pex2P55098 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Pex2P55098 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Pex2P55098 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms