Protein–RNA interactions for Protein: P55088

Aqp4, Aquaporin-4, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aqp4P55088 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Aqp4P55088 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Aqp4P55088 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms