Protein–RNA interactions for Protein: P54987

Acod1, Cis-aconitate decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acod1P54987 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acod1P54987 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Acod1P54987 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Acod1P54987 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms