Protein–RNA interactions for Protein: P54754

Ephb3, Ephrin type-B receptor 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ephb3P54754 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ephb3P54754 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ephb3P54754 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms