Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Gpc4P51655 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gpc4P51655 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms