Protein–RNA interactions for Protein: P50228

Cxcl5, C-X-C motif chemokine 5, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl5P50228 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Cxcl5P50228 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cxcl5P50228 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms