Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pax7P47239 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pax7P47239 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms