Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rab20P35295 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms