Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Etv4P28322 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Etv4P28322 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms