Protein–RNA interactions for Protein: P20489

Fcer1a, High affinity immunoglobulin epsilon receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcer1aP20489 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Fcer1aP20489 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms