Protein–RNA interactions for Protein: P19228

Csn1s1, Alpha-S1-casein, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csn1s1P19228 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Csn1s1P19228 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Csn1s1P19228 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Csn1s1P19228 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Csn1s1P19228 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms