Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Tnnc1P19123 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Tnnc1P19123 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms