Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rps6ka3P18654 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms