Protein–RNA interactions for Protein: P16305

Gabra6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra6P16305 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Gabra6P16305 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gabra6P16305 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms