Protein–RNA interactions for Protein: P15532

Nme1, Nucleoside diphosphate kinase A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme1P15532 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nme1P15532 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nme1P15532 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms