Protein–RNA interactions for Protein: P11609

Cd1d1, Antigen-presenting glycoprotein CD1d1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd1d1P11609 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd1d1P11609 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cd1d1P11609 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms