Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lire1P11260 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lire1P11260 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lire1P11260 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lire1P11260 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms