Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnfP06804 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
TnfP06804 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
TnfP06804 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
TnfP06804 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TnfP06804 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TnfP06804 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TnfP06804 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TnfP06804 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TnfP06804 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TnfP06804 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms