Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Mtnd1P03888 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Mtnd1P03888 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms