Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Robo1O89026 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Robo1O89026 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Robo1O89026 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Robo1O89026 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Robo1O89026 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms