Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Ctnnal1O88327 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ctnnal1O88327 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms