Protein–RNA interactions for Protein: O70258

Sgce, Epsilon-sarcoglycan, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgceO70258 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SgceO70258 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SgceO70258 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgceO70258 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgceO70258 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgceO70258 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SgceO70258 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SgceO70258 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SgceO70258 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SgceO70258 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms