Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
CrxO54751 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
CrxO54751 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrxO54751 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrxO54751 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrxO54751 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrxO54751 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrxO54751 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrxO54751 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrxO54751 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
CrxO54751 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrxO54751 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrxO54751 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrxO54751 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrxO54751 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrxO54751 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
CrxO54751 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms