Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1mwO35599 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1mwO35599 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Opn1mwO35599 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Opn1mwO35599 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms