Protein–RNA interactions for Protein: M0QWL4

Gm3532, Predicted gene 3532 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3532M0QWL4 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm3532M0QWL4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm3532M0QWL4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms