Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm3685J3QPP2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm3685J3QPP2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3685J3QPP2 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3685J3QPP2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3685J3QPP2 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3685J3QPP2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3685J3QPP2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3685J3QPP2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm3685J3QPP2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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