Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm8356J3QPD3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm8356J3QPD3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms