Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm20918J3QN17 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm20918J3QN17 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm20918J3QN17 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm20918J3QN17 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm20918J3QN17 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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