Protein–RNA interactions for Protein: J3QM76

Ccdc179, Coiled-coil domain-containing protein 179, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc179J3QM76 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Ccdc179J3QM76 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms