Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r58G3X9U3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms