Protein–RNA interactions for Protein: F6UK53

4933403O08Rik, MCG62900, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933403O08RikF6UK53 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4933403O08RikF6UK53 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4933403O08RikF6UK53 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms