Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf165E9QAU8 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf165E9QAU8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf165E9QAU8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Rnf165E9QAU8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Rnf165E9QAU8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rnf165E9QAU8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnf165E9QAU8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Rnf165E9QAU8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms