Protein–RNA interactions for Protein: E9Q368

Tarbp1, TAR RNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tarbp1E9Q368 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tarbp1E9Q368 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tarbp1E9Q368 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tarbp1E9Q368 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms