Protein–RNA interactions for Protein: E1AZ71

Cngb1, Cyclic nucleotide-gated channel beta 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cngb1E1AZ71 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Cngb1E1AZ71 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
Cngb1E1AZ71 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Cngb1E1AZ71 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms