Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apba1B2RUJ5 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apba1B2RUJ5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms