Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm11127A7VMS2 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm11127A7VMS2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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Gm11127A7VMS2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Gm11127A7VMS2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm11127A7VMS2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
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