Protein–RNA interactions for Protein: A2AJN7

Slc4a11, Sodium bicarbonate transporter-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a11A2AJN7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Slc4a11A2AJN7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms